Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH17Q12864 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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