Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXO1Q12778 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXO1Q12778 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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