Protein–RNA interactions for Protein: Q12489

YDL012C, Cysteine-rich and transmembrane domain-containing protein YDL012C, yeastyeast

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL012CQ12489 TRM3YDL112W 4311 nt0.86□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 PMP2YEL017C-A 132 nt0.86□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 SOM1YEL059C-A 225 nt0.86□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 PRP16YKR086W 3216 nt0.86□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 YLR232WYLR232W 348 nt0.85□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 SAC3YDR159W 3906 nt0.84□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 STB6YKL072W 2301 nt0.84□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 OST4YDL232W 111 nt0.84□□□□□ -2.27
YDL012CQ12489 EST2YLR318W 2655 nt0.84□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 NUP145YGL092W 3954 nt0.84□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 KCS1YDR017C 3153 nt0.84□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.83□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 NUP192YJL039C 5052 nt0.83□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 BEM3YPL115C 3387 nt0.83□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 CAT8YMR280C 4302 nt0.83□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 RAD9YDR217C 3930 nt0.83□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 snR39BsnR39B 96 nt0.82□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.82□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.81□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 CDC25YLR310C 4770 nt0.81□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 TRM732YMR259C 4263 nt0.81□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YDL073WYDL073W 2955 nt0.81□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.8□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.79□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 CDC39YCR093W 6327 nt0.79□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 TFB5YDR079C-A 219 nt0.78□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YDR210WYDR210W 228 nt0.78□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.78□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 YLR041WYLR041W 321 nt0.78□□□□□ -2.28
YDL012CQ12489 ASE1YOR058C 2658 nt0.78□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 YBL109WYBL109W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 SPT7YBR081C 3999 nt0.77□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 SEC8YPR055W 3198 nt0.77□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.76□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 YJR029WYJR029W 5268 nt0.75□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.75□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 COG6YNL041C 2520 nt0.75□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 SEC3YER008C 4011 nt0.74□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.74□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 VAM6YDL077C 3150 nt0.73□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 MSH3YCR092C 3057 nt0.73□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.73□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 UBP3YER151C 2739 nt0.73□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 snR61snR61 90 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.72□□□□□ -2.29
YDL012CQ12489 BUD3YCL014W 4911 nt0.71□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YMR326CYMR326C 309 nt0.71□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 LAA1YJL207C 6045 nt0.71□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 KAP120YPL125W 3099 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 MYO1YHR023W 5787 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YBR178WYBR178W 375 nt0.7□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 MSN5YDR335W 3675 nt0.69□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 SEC1YDR164C 2175 nt0.69□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 NST1YNL091W 3723 nt0.69□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.68□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YCS4YLR272C 3531 nt0.68□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 RKR1YMR247C 4689 nt0.68□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 STF2YGR008C 255 nt0.67□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YNL266WYNL266W 420 nt0.67□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 YSP1YHR155W 3687 nt0.67□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 CSE1YGL238W 2883 nt0.67□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 BIR1YJR089W 2865 nt0.66□□□□□ -2.3
YDL012CQ12489 RCO1YMR075W 2055 nt0.65□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 ANS1YHR126C 480 nt0.65□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 BEM2YER155C 6504 nt0.65□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YGR130CYGR130C 2451 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 SCC2YDR180W 4482 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YHR217CYHR217C 462 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 GLG1YKR058W 1851 nt0.64□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 DOP1YDR141C 5097 nt0.63□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 HUG1YML058W-A 207 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 IML1YJR138W 4755 nt0.62□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YPR117WYPR117W 7470 nt0.61□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 ROM2YLR371W 4071 nt0.6□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 NNF2YGR089W 2811 nt0.6□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 SIP4YJL089W 2490 nt0.6□□□□□ -2.31
YDL012CQ12489 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.58□□□□□ -2.32
YDL012CQ12489 ULP2YIL031W 3105 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL012CQ12489 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL012CQ12489 SEC10YLR166C 2616 nt0.57□□□□□ -2.32
YDL012CQ12489 NIP1YMR309C 2439 nt0.56□□□□□ -2.32
YDL012CQ12489 snR81snR81 201 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms