Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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