Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC173Q0VFZ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms