Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms