Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL1Q08397 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms