Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms