Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms