Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms