Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms