Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERCC6Q03468 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ERCC6Q03468 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms