Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPCQ03188 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms