Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF8Q02556 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms