Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms