Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms