Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGD1P98174 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGD1P98174 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD1P98174 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms