Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD3P84022 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms