Protein–RNA interactions for Protein: P83110

HTRA3, Serine protease HTRA3, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA3P83110 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTRA3P83110 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA3P83110 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA3P83110 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA3P83110 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA3P83110 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA3P83110 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms