Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRB1P82279 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRB1P82279 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRB1P82279 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRB1P82279 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRB1P82279 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRB1P82279 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRB1P82279 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRB1P82279 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRB1P82279 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms