Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms