Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP1S1P61966 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms