Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RND3P61587 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RND3P61587 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RND3P61587 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RND3P61587 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RND3P61587 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms