Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVK-16P61578 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms