Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM258P61165 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM258P61165 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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