Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPIFB3P59826 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPIFB3P59826 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BPIFB3P59826 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPIFB3P59826 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms