Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF3P57682 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms