Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX17P56962 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX17P56962 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX17P56962 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX17P56962 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX17P56962 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX17P56962 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX17P56962 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX17P56962 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX17P56962 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms