Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms