Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms