Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATN1P54259 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATN1P54259 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATN1P54259 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATN1P54259 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms