Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 UFD2YDL190C 2886 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YGR130CYGR130C 2451 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 QCR9YGR183C 201 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.04□□□□□ -2.24
APJ1P53940 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.03□□□□□ -2.24
APJ1P53940 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
APJ1P53940 BFR2YDR299W 1605 nt1.03□□□□□ -2.24
APJ1P53940 EST2YLR318W 2655 nt1.02□□□□□ -2.25
APJ1P53940 STF2YGR008C 255 nt1.02□□□□□ -2.25
APJ1P53940 AZF1YOR113W 2745 nt1.02□□□□□ -2.25
APJ1P53940 MSN5YDR335W 3675 nt1.02□□□□□ -2.25
APJ1P53940 UTP8YGR128C 2142 nt1.01□□□□□ -2.25
APJ1P53940 VAM6YDL077C 3150 nt1.01□□□□□ -2.25
APJ1P53940 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.01□□□□□ -2.25
APJ1P53940 YLL020CYLL020C 306 nt1.01□□□□□ -2.25
APJ1P53940 RAD50YNL250W 3939 nt1□□□□□ -2.25
APJ1P53940 NUT1YGL151W 3399 nt1□□□□□ -2.25
APJ1P53940 TAH1YCR060W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
APJ1P53940 EMC5YIL027C 426 nt0.99□□□□□ -2.25
APJ1P53940 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
APJ1P53940 COG6YNL041C 2520 nt0.98□□□□□ -2.25
APJ1P53940 KAP122YGL016W 3246 nt0.98□□□□□ -2.25
APJ1P53940 COX5BYIL111W 456 nt0.98□□□□□ -2.25
APJ1P53940 NST1YNL091W 3723 nt0.97□□□□□ -2.25
APJ1P53940 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.97□□□□□ -2.25
APJ1P53940 snR14snR14 160 nt0.97□□□□□ -2.25
APJ1P53940 ALY2YJL084C 3141 nt0.97□□□□□ -2.25
APJ1P53940 SLX4YLR135W 2247 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 snR81snR81 201 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 HUG1YML058W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 snR45snR45 172 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YAR009CYAR009C 3591 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 MMS4YBR098W 2076 nt0.96□□□□□ -2.26
APJ1P53940 PAN2YGL094C 3348 nt0.95□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YDR210WYDR210W 228 nt0.95□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YML002WYML002W 2214 nt0.94□□□□□ -2.26
APJ1P53940 NUP188YML103C 4968 nt0.94□□□□□ -2.26
APJ1P53940 BUD3YCL014W 4911 nt0.93□□□□□ -2.26
APJ1P53940 SMC1YFL008W 3678 nt0.93□□□□□ -2.26
APJ1P53940 KAP120YPL125W 3099 nt0.92□□□□□ -2.26
APJ1P53940 FYV10YIL097W 1551 nt0.92□□□□□ -2.26
APJ1P53940 SIP4YJL089W 2490 nt0.92□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YLR041WYLR041W 321 nt0.92□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.91□□□□□ -2.26
APJ1P53940 YLR232WYLR232W 348 nt0.91□□□□□ -2.26
APJ1P53940 DOP1YDR141C 5097 nt0.91□□□□□ -2.26
APJ1P53940 NOP9YJL010C 2001 nt0.91□□□□□ -2.26
APJ1P53940 ASE1YOR058C 2658 nt0.91□□□□□ -2.26
APJ1P53940 TRM732YMR259C 4263 nt0.9□□□□□ -2.26
APJ1P53940 STO1YMR125W 2586 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 BIR1YJR089W 2865 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YNL266WYNL266W 420 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 SET3YKR029C 2256 nt0.9□□□□□ -2.27
APJ1P53940 GEA2YEL022W 4380 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 SEC3YER008C 4011 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 snR190snR190 190 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 IML1YJR138W 4755 nt0.89□□□□□ -2.27
APJ1P53940 SEC1YDR164C 2175 nt0.88□□□□□ -2.27
APJ1P53940 WAR1YML076C 2835 nt0.87□□□□□ -2.27
APJ1P53940 snR62snR62 100 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 RPL26BYGR034W 384 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.86□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.85□□□□□ -2.27
APJ1P53940 YCS4YLR272C 3531 nt0.85□□□□□ -2.27
APJ1P53940 APL3YBL037W 3078 nt0.85□□□□□ -2.27
APJ1P53940 ROM2YLR371W 4071 nt0.84□□□□□ -2.28
APJ1P53940 SWI4YER111C 3282 nt0.83□□□□□ -2.28
APJ1P53940 YDL073WYDL073W 2955 nt0.83□□□□□ -2.28
APJ1P53940 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
APJ1P53940 CDC39YCR093W 6327 nt0.81□□□□□ -2.28
APJ1P53940 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.81□□□□□ -2.28
APJ1P53940 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.8□□□□□ -2.28
APJ1P53940 NNF2YGR089W 2811 nt0.8□□□□□ -2.28
APJ1P53940 NUP145YGL092W 3954 nt0.79□□□□□ -2.28
APJ1P53940 RPS26AYGL189C 360 nt0.79□□□□□ -2.28
APJ1P53940 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.79□□□□□ -2.28
APJ1P53940 CLU1YMR012W 3834 nt0.79□□□□□ -2.28
APJ1P53940 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.78□□□□□ -2.28
APJ1P53940 UBP3YER151C 2739 nt0.78□□□□□ -2.29
APJ1P53940 SEC8YPR055W 3198 nt0.77□□□□□ -2.29
APJ1P53940 PRP16YKR086W 3216 nt0.77□□□□□ -2.29
APJ1P53940 MYO1YHR023W 5787 nt0.76□□□□□ -2.29
APJ1P53940 SEC10YLR166C 2616 nt0.76□□□□□ -2.29
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