Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA4P52798 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms