Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP11P51784 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP11P51784 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP11P51784 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP11P51784 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP11P51784 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP11P51784 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP11P51784 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms