Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRE11P49959 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRE11P49959 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRE11P49959 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms