Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AMPHP49418 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMPHP49418 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMPHP49418 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AMPHP49418 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMPHP49418 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMPHP49418 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMPHP49418 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMPHP49418 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMPHP49418 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AMPHP49418 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMPHP49418 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMPHP49418 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AMPHP49418 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMPHP49418 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms