Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCR1P46094 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCR1P46094 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCR1P46094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms