Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP5P45974 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP5P45974 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP5P45974 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP5P45974 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP5P45974 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP5P45974 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP5P45974 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP5P45974 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
USP5P45974 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP5P45974 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP5P45974 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms