Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMPOP42166 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMPOP42166 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPOP42166 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPOP42166 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPOP42166 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPOP42166 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms