Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPHP41219 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPHP41219 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPHP41219 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPHP41219 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPHP41219 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPHP41219 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPHP41219 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPHP41219 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms