Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGAEP38570 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms