Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB2P35606 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB2P35606 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPB2P35606 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPB2P35606 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms