Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF2P35227 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF2P35227 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms