Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJA4P35212 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJA4P35212 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA4P35212 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA4P35212 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.8 ms