Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND3P30281 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND3P30281 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND3P30281 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND3P30281 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND3P30281 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND3P30281 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND3P30281 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND3P30281 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms