Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID4AP29374 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms