Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB2P29033 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB2P29033 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB2P29033 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB2P29033 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB2P29033 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms