Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IL3RAP26951 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms