Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms