Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2AP24928 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms